ユビキチン非依存的なMidnolin-プロテアソーム経路の構造的洞察

学術的背景 タンパク質恒常性(プロテオスタシス)は細胞の正常な機能維持の中核的メカニズムであり、ユビキチン-プロテアソームシステム(Ubiquitin-Proteasome System, UPS)は異常タンパク質の約80%を分解する役割を担っている。従来の認識では、タンパク質はユビキチン化標識を必要とすると考えられてきた。しかし近年の研究で、EGR1やFOSBなどの転写因子がユビキチン化に依存せず直接分解される現象が発見され、これがリンパ球の発生や悪性腫瘍と密接に関連することが明らかとなった。特にMidnolinタンパク質はこの過程を仲介する鍵因子として同定されたが、その構造的基盤と分子メカニズムは長らく不明であった。 本研究はUT Southwestern Medical Centerの...

Park7の非従来型分泌にはシャペロン介在オートファジーと特殊化SNARE複合体を介したリソソーム輸送が必要

一、研究背景 パーキンソン病関連タンパク質PARK7/DJ-1(以下PARK7)は、神経変性疾患、がん、炎症など多様な病理状態で重要な役割を果たす多機能タンパク質である。従来型のN末端シグナルペプチドを欠いているにもかかわらず、ストレス条件下で細胞外に分泌され、様々な疾患患者の脳脊髄液や血液中でその分泌量が顕著に上昇することが確認されている。しかし、PARK7の非古典的分泌の具体的なメカニズムは長年不明であった。 先行研究では、6-ヒドロキシドーパミン(6-OHDA)誘導性の酸化ストレスがオートファジー経路を介してPARK7分泌を促進することが示されたが、この過程における以下の核心的な問題は未解決だった: 1. 酸化ストレス条件下でPARK7が分子シャペロン介導性オートファジー(CMA)経路...

METTL3がアテロプローン血流誘発内皮細胞糖酵解を媒介する

一、研究背景 動脈硬化(atherosclerosis)は心血管疾患の主要な病理基盤であり、その発生は血管内皮細胞(endothelial cells, ECs)の機能障害と密接に関連しています。血流力学要因は動脈硬化の地域選択性において決定的な役割を果たします:振動せん断応力(oscillatory shear stress, OS)(血管分岐部など)はプラーク形成を促進し、脈動せん断応力(pulsatile shear stress, PS)(直線血管部)は保護作用を示します。近年の研究で、ECsはOS作用下で代謝再プログラミング(metabolic reprogramming)が起こり、解糖系(glycolysis)が亢進することが明らかになりましたが、具体的な分子メカニズムは未解明で...

Deep scSTAR: 単細胞RNAシーケンシングおよび空間トランスクリプトミクスデータからの表現型関連特徴の抽出と強化のための深層学習の活用

近年、シングルセルRNAシーケンシング(scRNA-seq)及び空間トランスクリプトミクス(spatial transcriptomics, ST)などの先端技術は、生命科学・臨床医学の発展を飛躍的に促進してきました。これらの技術は細胞異質性を明らかにし、疾患、発生、免疫などの重要領域に新たな知見をもたらしました。しかし、大規模シングルセルデータは技術ノイズが強く、バッチ効果(batch effects)が複雑で、生物学的シグナルが多様かつ雑然としているため、「表現型に関連した特徴の正確な抽出と強調」が最大の課題の一つとなっています。多くの従来手法はノイズ除去や統合を主目的としていますが、同時に研究の鍵となる表現型決定シグナルを弱めたり、消失させたりしてしまい、疾患機構や細胞間相互作用の理解...

がんにおける神経浸潤の評価による新たな癌の特徴の解明

癌症は世界的に重大な公衆衛生上の課題であり、その発生および進展のメカニズムは極めて複雑です。長年にわたり、腫瘍微小環境(tumor microenvironment,TME)の免疫、炎症、血管新生などのプロセスが広く注目され、腫瘍の生物学的挙動の重要な決定要因と見なされてきました。近年、「がん神経科学(cancer neuroscience)」という新たな学際分野が誕生し、神経系が神経伝達物質や神経ペプチドなどによって腫瘍の発展を調節し、また神経-腫瘍細胞間の直接または間接的な相互作用を通じて、腫瘍の成長・転移・浸潤に影響することが明らかになってきました。「末梢神経浸潤(perineural invasion, PNI)」など神経関連現象が注目されているものの、腫瘍疾患における「神経浸潤」の...

MHCクラスIIとペプチド配列を利用したインターフェロン-ガンマ放出予測の多様なアプローチの探求

学術的背景と研究の意義 近年、治療用タンパク質(therapeutic proteins)は医学分野での大きな可能性のため、バイオ医薬品産業の研究焦点となっています。治療用タンパク質医薬はその高い標的性を強みとし、従来治療が困難であった急性または慢性疾患(自己免疫疾患、癌など)に対して解決策を提供すると考えられています。1880年代の血清療法の発見から、1986年の初のモノクローナル抗体医薬muromonab-CD3の登場まで、治療用タンパク質市場は拡大の一途をたどり、2032年には推定474億米ドルに到達します。しかし、治療用タンパク質が引き起こす免疫応答(immunogenicity)は、薬物開発者にとって長年の悩みです。免疫応答は有害な副作用をもたらすだけでなく、治療機序としても機能し...