利用基于细胞学的深度学习预测未知原发性癌症的肿瘤起源

利用基于细胞学的深度学习预测未知原发性癌症的肿瘤起源

背景介绍 肿瘤未明原发癌(Cancer of Unknown Primary, CUP)是一类通过组织病理学确认为恶性转移但无法通过常规基线诊断方法明确原发部位的恶性疾病。CUP在临床中具有较大的诊断挑战和治疗难度,被认为占所有人类癌症的3-5%。其中,腺癌是最常见的病理类型,其次是鳞状细胞癌和未分化癌。尽管采用了一系列联合化疗治疗手段,患者的整体预后依然极差,仅有20%的患者可以达到10个月的中位生存期。CUP的一个显著特征是其早期扩散、侵袭性较强的临床表现和多器官受累的特点。 免疫组化试验(Immunohistochemistry, IHC)通常被用作预测CUP可能原发部位的关键手段,然而,通过大约20种不同免疫染色单元组合,仅不到30%的CUP病例能够被精确定位。因而,准确预测原发部位...

靶向EGFR和IL13Rα2的双价CAR T细胞治疗复发胶质母细胞瘤的效果:一期试验的中期结果

靶向EGFR和IL13Rα2的双价CAR T细胞治疗复发胶质母细胞瘤的效果:一期试验的中期结果

靶向EGFR和IL13Rα2的双价CAR T细胞治疗复发胶质母细胞瘤的效果 近年来,复发性胶质母细胞瘤(RGBM)的治疗不断探讨和改进,但总体生存率仍不到1年,治疗依旧面临巨大挑战。现有治疗方法的局限性及复发性胶质母细胞瘤的复杂性,使得科学家们持续在不同治疗方法上进行探索。本文报道了一项在Nature Medicine期刊上发表的临床试验中期结果,文章主要研究靶向EGFR和IL13Rα2的双靶点嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)疗法在复发性胶质母细胞瘤患者中的应用。 研究背景与动机 复发性胶质母细胞瘤是一种高度恶性的脑肿瘤,常规的放疗和化疗在复发性病例中的疗效有限,且当前尚无标准的治疗方法。因此,开发更加有效的治疗方式成为了医学研究的重要目标。嵌合抗原受体T细胞疗法(CAR-T therapy...

结合GLP-1受体激动剂和NMDA受体拮抗剂用于肥胖治疗

GLP-1-Directed NMDA受体拮抗治疗肥胖 近几十年来,肥胖已成为全球性健康问题,严重影响了数百万人的生活质量和健康状况。肥胖症不仅与糖尿病、高血压、心血管疾病等多种健康问题有关,还严重影响心理健康。因此,寻找有效的肥胖症治疗方法显得尤为重要。 在这一背景下,Jonas Petersen等科学家团队开展了一项创新研究,探讨了结合GLP-1(胰高血糖素样肽-1)受体激动剂和NMDA(N-甲基-D-天冬氨酸)受体拮抗剂的双模分子(GLP-1–MK-801)在肥胖治疗中的潜力。本文将在《Nature》期刊发表。 研究背景与目的 NMDA受体是一种由谷氨酸激活的阳离子通道,在大脑的许多过程中起着关键作用。基因组广泛关联研究(GWAS)表明,谷氨酸能神经传递和NMDA受体介导的突触可塑性在...

整合分子和空间分析揭示原位和侵袭性肢端黑色素瘤的演化动力学和肿瘤-免疫相互作用

整合分子和空间分析揭示原位和侵袭性肢端黑色素瘤的演化动力学和肿瘤-免疫相互作用

整合分子和空间分析揭示原位和侵袭性肢端黑色素瘤的进化动力学及肿瘤-免疫相互作用 论文的学术背景 黑色素瘤是皮肤癌的一种,而肢端黑色素瘤(Acral Melanoma, AM)是一种在手掌、足底以及指甲下发生的非暴露部位黑色素瘤,尤为常见于亚洲人群。然而,这类黑色素瘤常常在晚期才被诊断,这使得其预后极差。尽早发现和预防AM可以显著提高患者的预后。尽管近年来对于晚期侵袭性肢端黑色素瘤(Invasive Acral Melanoma, IAM)的基因组特征进行了大量研究,但对于早期原位肢端黑色素瘤(Acral Melanoma In Situ, AMIS)的了解仍然非常有限。因此,探讨AM从原位阶段到侵袭性阶段的进化动力学,以及其与肿瘤微环境(Tumor Microenvironment, TME...

针对PRMT9介导的精氨酸甲基化抑制癌干细胞的维持并诱发CGAS介导的抗癌免疫反应

这项研究围绕蛋白质精氨酸甲基转移酶PRMT9展开,揭示了PRMT9在急性髓系白血病(AML)中的重要作用及其作为一个潜在的抗癌靶点。研究人员发现,PRMT9在AML干细胞和白血病细胞中表达水平显著升高。通过基因编辑和化学探针的方式,他们发现抑制PRMT9不仅可以抑制癌细胞的生存,还可以诱导癌细胞的DNA损伤和细胞循环阻滞,激活了细胞内的cGAS-STING信号通路,从而引发I型干扰素反应,激活树突状细胞并刺激T细胞免疫。 该研究由约翰霍普金斯大学的Ling Li博士和其合作者共同完成,相关成果发表于2024年4月出版的《自然-癌症》杂志上。 研究细节如下: 研究背景介绍 研究人员注意到,尽管目前的抗癌疗法能够杀伤大部分癌细胞,但仍难以彻底根治,因为癌细胞可能通过未知机制劫持正常的精氨酸甲基化...

5'非翻译区语言模型用于解码mRNA的非翻译区域和功能预测

5'非翻译区语言模型用于解码mRNA的非翻译区域和功能预测

5’非翻译区(5’UTR)是信使RNA(mRNA)分子起始端的一个调控区域,在调节翻译过程及影响蛋白质表达水平方面发挥着关键作用。语言模型已展现出解码蛋白质和基因组序列功能的有效性。在这项研究中,作者们介绍了一种针对5’UTR的语言模型,简称为UTR-LM。 研究背景 事实上,5’UTR在调控mRNA的翻译过程中扮演着重要角色,可以影响mRNA的稳定性、定位和翻译效率。之前已有大量研究探索了5’UTR的生物学特征,包括它的二级结构、可能与之互作的RNA结合蛋白,以及5’UTR突变对基因表达的影响等。mRNA的复杂功能及其对人类健康的潜在影响,凸显了需要开发更具普遍适用性的计算方法。 研究来源 本研究由普林斯顿大学电子与计算机工程系的Mengdi Wang教授课题组、斯坦福大学病理系的Le C...