基于预训练大型语言模型的人类蛋白质必要性预测与分析 学术背景 人类必需蛋白质（Human Essential Proteins, HEPs）对个体的生存和发育至关重要。然而，实验方法识别HEPs通常成本高、耗时长且劳动强度大。此外，现有的计算方法仅在细胞系水平上预测HEPs，但HEPs在活体人类、细胞系和动物模型之间差异显著。因此，开发一种能够在多个水平上全面预测HEPs的计算方法显得尤为重要。最近，大型语言模型（Large Language Models, LLMs）在自然语言处理领域取得了显著成功，蛋白质语言模型（Protein Language Models, PLMs）也因其能够在大规模蛋白质序列上进行预训练而崭露头角。然而，PLMs是否能够显著提高蛋白质必要性预测任务的效果仍然未知...

探讨运动病的生物标志物与生物传感器：解决诊断难题的创新方向 运动病（Motion Sickness，MS）是人类普遍经历的一种综合症，发生在交通工具或者虚拟现实（Virtual Reality，VR）所引起的非自然运动中。它的特征包括头痛、恶心、呕吐、出虚汗及肤色苍白等，严重时还可能导致脱水、电解质紊乱及其他躯体和心理上的不良后果。然而，由于缺乏可靠的客观指标及实时检测方法，运动病的精确诊断一直是医疗领域中的难题。尽管已有研究显示一些生理和生化指标可能与运动病的发生相关，但尚未形成系统的研究综述和统一的技术解决路径。为此，《Biosensors and Biomarkers for the Detection of Motion Sickness》这一科学论文集中探讨了运动病的病理机制、潜在...

双靶点外显子跳跃反义寡核苷酸药物在杜氏肌营养不良症中的新进展：Brogidirsen的I/II期临床试验 背景介绍 杜氏肌营养不良症（Duchenne Muscular Dystrophy, DMD）是一种致命的遗传性疾病，主要影响骨骼肌和心肌功能，导致患者早期丧失行动能力，甚至器官衰竭。截至目前，DMD尚无根治方法。其病因是由X染色体短臂（Xp21.2）的DMD基因突变引起，导致编码的抗肌萎缩蛋白（Dystrophin）缺失或异常。抗肌萎缩蛋白是维持肌细胞膜结构稳定的关键蛋白，其缺失会引发肌纤维的逐渐退化，最终导致肌肉坏死和功能衰退。 目前的DMD治疗策略中，外显子跳跃疗法（Exon-Skipping Therapy）是一种极具潜力的分子治疗方法，通过短链反义寡核苷酸（Antisense ...

背景介绍 本文研究聚焦在恶性胸膜间皮瘤（malignant pleural mesothelioma, MPM）这一罕见且高度致命的癌症，这种癌症与石棉暴露高度相关。目前病人确诊时大多已进入晚期，生存时间一般仅为12至15个月，传统治疗方式为以铂类药物为基础的化疗。然而，随着免疫检查点抑制剂（immune checkpoint inhibitors, ICIs）以及免疫化疗联合疗法的引入，治疗模式正在发生重大转变。尽管这些疗法在某些患者中表现出显著临床疗效，但实际疗效仍具有高度的个体差异性。迄今为止，缺乏可指导治疗决策的预测性生物标志物（biomarkers），使得临床医生难以判断患者是否能够从治疗中获益并衡量治疗的潜在副作用风险。因此，本研究尝试在肿瘤微环境（tumor microenvi...

放疗联合免疫化疗在局部晚期直肠癌中介导TREM1+单核-巨噬细胞的可塑性研究：一项综合性多组学研究 背景介绍 直肠癌是全球第二大癌症相关死亡的主要诱因，占所有结直肠癌病例的三分之一。尽管手术和新辅助放化疗（neoadjuvant chemoradiotherapy, CRT）在局部晚期直肠癌（locally advanced rectal cancer, LARC）中的应用得到了广泛认可，但其效果仍然不尽如人意。传统治疗的病理完全缓解率（pathological complete response, pCR）仅在15%-30%，且30%患者会出现远处转移。这些临床难题促使科学家们探索更有效的治疗方案。近年来，免疫检查点抑制剂（immune checkpoint inhibitors, ICI...

基于外周血单核细胞DNA甲基化的早期肺腺癌诊断新方法 背景介绍 肺腺癌（Lung Adenocarcinoma, LUAD）是全球癌症相关死亡的主要原因之一，占肺癌病例的约40%。尽管近年来肺腺癌的治疗取得了显著进展，但其预后仍然不佳，主要原因之一是早期诊断的困难。大多数患者在首次就诊时已进入晚期，导致治疗效果不佳。目前，低剂量计算机断层扫描（Low-Dose Computed Tomography, LDCT）是早期肺腺癌筛查的常用工具，但其假阳性率高达96.4%，且现有的血清生物标志物（如CEA）在早期肺腺癌诊断中的敏感性和特异性较低。因此，开发一种非侵入性、高效的早期肺腺癌诊断方法具有重要意义。 DNA甲基化（DNA Methylation）是一种常见的表观遗传修饰，在基因表达的调控中...