光漂白动力学坐标系中马达驱动的微管扩散

以光控马达和光漂白为窗口,揭示细胞骨架主动物质网络的全局收缩与局部弥散——解读原始研究“motor-driven microtubule diffusion in a photobleached dynamical coordinate system” 学术研究背景 主动物质(Active matter)系统是近年生物物理学和合成生物学领域的前沿话题。主动物质指的是由能够消耗能量并用于自身运动或产生力的“主动组分”组成的系统,例如分子马达(molecular motors)和细胞骨架(cytoskeleton)纤维等。主动物质系统广泛存在于生物体内,从单细胞到多细胞组织,甚至动物个体层面的集体行为(如鱼群协作游动)都可见主动物质系统的组织和动力学特征。 主动物质的一个显著特征,是其可以在没有...

面向偏差感知的网络生物学链路预测算法的训练与评估

揭示连边预测算法的“富节点”偏见及其应对新策略 —— 解读“Bias-aware Training and Evaluation of Link Prediction Algorithms in Network Biology” 一、学术背景与研究缘起 在过去的十年里,生物网络(network biology)在揭示生物分子关联与功能方面扮演着愈加重要的角色。随着蛋白-蛋白互作(protein–protein interaction, PPI)、疾病基因关系等大规模图谱数据不断丰富,基于图机器学习的连边预测(link prediction, 连边意指网络中节点之间的关联)成为生物信息学和计算生物学中的核心工具。连边预测算法被广泛用于发现未知的生物分子关联,有助于药物靶点发现、疾病机制研究、实...

健康寿命蛋白质组特征的开发与验证

一、学术背景:从寿命延长到健康寿命的增进 随着20世纪以来全球医疗和社会经济水平的提高,人类整体寿命(Lifespan)显著延长,尤其是在发展中国家。然而,健康寿命(Healthspan)——即个体在无重大慢性疾病和功能障碍、保持全面健康状态下生活的年限——却未能与寿命同步增长。这在全球范围内造成了“健康寿命缺口”(healthspan-lifespan gap),使越来越多的人口虽然生命得以延长,但晚年多伴随慢性疾病、残疾和功能丧失,造成巨大社会、经济和医疗负担。 面对这一挑战,抗衰老生物学领域出现了“老年医学科学”(Geroscience)研究范式。与以往仅聚焦单一疾病的防治不同,Geroscience强调同时针对影响衰老进程的核心生物学机制(如炎症、免疫失衡、代谢异常、细胞功能障碍等“...

小胶质细胞转录状态及其功能意义:环境驱动多样性

学术背景 小胶质细胞(microglia)是中枢神经系统(CNS)中唯一的常驻巨噬细胞,在发育、稳态和疾病中发挥关键作用。传统观点认为小胶质细胞是均一的“静息”或“激活”状态,但单细胞测序技术的出现揭示了其显著的转录异质性。然而,这种异质性的功能意义、驱动因素以及跨物种(如小鼠与人类)的差异仍不明确。 本综述由Beth Stevens团队撰写,旨在系统梳理小胶质细胞在不同环境(如发育、衰老、神经退行性疾病)中的转录状态多样性,探讨状态与功能的关联,并分析人类小胶质细胞研究的挑战与策略,为靶向小胶质细胞的治疗提供理论框架。 论文来源 作者:Constanze Depp、Jordan L. Doman等(共同一作),Beth Stevens(通讯作者) 机构:Boston Children’s ...

星形胶质细胞中的炎症小体信号调节海马可塑性

学术背景 近年来,免疫信号通路在神经系统稳态中的作用逐渐受到关注。传统观点认为,炎症小体(inflammasome)作为先天免疫的核心复合物,仅在感染或组织损伤时激活,通过 caspase-1 介导的细胞焦亡(pyroptosis)和促炎因子(如 IL-1β、IL-18)释放参与病理过程。然而,越来越多的证据表明,免疫分子在健康大脑的生理功能中同样发挥重要作用。例如,警报素(alarmin)IL-33 虽在炎症中起促炎作用,但也被发现对海马突触可塑性(synaptic plasticity)至关重要。 本研究旨在解决以下关键问题: 1. 炎症小体在健康成体大脑中是否具有生理性激活? 2. 星形胶质细胞(astrocyte)的炎症小体信号如何影响海马功能? 3. 其下游效应分子(如 IL-18...

IL-10信号通过肺间质巨噬细胞防止细菌失调驱动的肺部炎症并维持免疫稳态

一、研究背景 慢性肺部炎症(chronic lung inflammation)与纤维化(pulmonary fibrosis)的发病机制尚不明确,尤其关于肺部共生菌群(commensal microbiota)与免疫系统互作的影响缺乏深入认知。白细胞介素-10(IL-10)作为关键抗炎细胞因子,在肠道稳态中的作用已被广泛研究,但其在肺部免疫调控中的功能仍存在空白。本研究聚焦于IL-10信号缺失如何通过肺部间质巨噬细胞(interstitial macrophages, IMs)引发细菌失调(dysbiosis)驱动的炎症,并探索其与Th17细胞、单核细胞(monocytes)的协同作用机制。 二、论文来源 本研究由Seung Hyon Kim(伊利诺伊大学芝加哥分校药理学与再生医学系)、T...