非人灵长类动物疫苗接种引发广泛中和抗体谱系靶向HIV-1 Env三聚体的四元表位

一、研究背景

人类免疫缺陷病毒(HIV-1)的包膜糖蛋白(Env)是中和抗体的主要靶点,但其高度变异性导致疫苗开发困难。自然感染中,广谱中和抗体(broadly neutralizing antibodies, bnAbs)罕见且需数年才出现。Env三聚体模拟物(如BG505 SOSIP.664)虽能稳定呈现天然构象,但既往疫苗研究多仅诱导出毒株特异性中和抗体,难以覆盖全球流行的HIV-1亚型。本研究旨在通过糖基化修饰的异源三聚体序贯免疫策略,探索聚焦于保守CD4结合位点(CD4 binding site, CD4bs)的bnAbs诱导机制。

二、论文来源

  • 作者团队:由Fabian-Alexander Schleich(卡罗林斯卡医学院)、Shridhar Bale与Javier Guenaga(斯克里普斯研究所)等跨国团队合作完成。
  • 通讯作者:Gunilla B. Karlsson Hedestam(卡罗林斯卡医学院)与Richard T. Wyatt(斯克里普斯研究所)。
  • 发表期刊:*Immunity*(2025年6月10日,第58卷),Elsevier出版。

三、研究流程与结果

1. 免疫原设计与动物实验

关键步骤:

  • 免疫原改造
    • 使用16055 dg4 NFL三聚体(缺失CD4bs附近的4个N-糖基化位点:N276/N301/N360/N463),暴露保守表位。
    • 引入跨原体二硫键(CC3:A501C-A662C)增强三聚体稳定性(图1)。
  • 动物模型
    • 12只恒河猴(非人灵长类动物,NHPs)分两组:
    • 组1(NHP1-6):可溶性三聚体免疫;
    • 组2(NHP7-12):三聚体-脂质体偶联物免疫。
    • 免疫方案
    1. 预免疫:BG505/CH505嵌合三聚体 + AMC016三聚体(靶向融合肽);
    2. 初免:16055 dg4 NFL三聚体(聚焦CD4bs);
    3. 加强免疫:异源全糖基化三聚体(ZM233、CH119、JR-FL等),间隔12周(图2a)。

实验结果:

  • 血清中和活性
    • 二次免疫后(post-2),NHP1和NHP9出现对tier 2病毒(如JR-FL)的交叉中和(图2c);
    • 六次免疫后(post-6),中和广度提升至覆盖84株全球病毒面板的70%(图4)。

2. 单克隆抗体分离与表征

关键步骤:

  • 记忆B细胞分选
    • 使用生物素化JR-FL NFL三聚体探针,通过流式细胞术分选抗原特异性B细胞(图S3a)。
    • 从NHP1中分离出185对重链/轻链序列,归属49个克隆谱系。
  • 抗体特性分析
    • LJF-0034谱系
    • 高频突变(重链SHM 12%,轻链SHM 9%);
    • 靶向四级表位:跨越相邻原体的CD4bs与V3区(图5c);
    • 中和广度:覆盖84株病毒中的66%(图4),IC50均值2.14 μg/mL(LJF-0085)。

结构解析:

  • 冷冻电镜(cryo-EM)
    • 结合模式:轻链结合CD4bs(避开N276糖链),重链结合V3区(图5d-e);
    • 表位特征
    • 轻链与保守残基D457/K282形成盐桥(图6a);
    • 重链通过HCDR2与V3区R308相互作用(图6c)。

3. 自然耐药机制与表位优化

关键发现:

  • 耐药位点
    • 对AE重组毒株(如C1080.c3)的中和抵抗由V3区(T305/T308/V316/R319)和CD4bs(G429/D474/R476)突变导致(图7b);
    • 回复突变(如T308R)可恢复中和敏感性(图7c)。
  • 糖链影响
    • 去除N197糖链显著增强中和效力,而N276糖链无影响(图7c)。

四、研究结论与价值

  1. 科学意义

    • 首次证明异源三聚体序贯免疫可诱导靶向Env四级表位的bnAbs;
    • 揭示了CD4bs与V3区协同表位的结构基础,为疫苗设计提供新靶点。
  2. 应用价值

    • 糖基化工程策略(如N197缺失)可优化免疫原设计;
    • LJF-0034谱系抗体为被动免疫治疗提供候选分子。

五、研究亮点

  • 创新方法
    • 跨原体二硫键(CC3)稳定三聚体构象;
    • 个体化Ig基因分型(IgDiscover算法)精准追踪抗体演化。
  • 重要发现
    • 四级表位bnAbs通过分叉结合模式规避糖链障碍;
    • 自然耐药机制指导疫苗株优化(如V3区保守性改造)。

六、其他信息

  • 数据公开
    • 抗体序列(GenBank)、冷冻电镜结构(EMDB/PDB)已公开;
    • 代码与算法详见GitLab(IgDiscover)。
  • 临床转化
    • 16055 dg4 NFL三聚体已进入I期临床试验(HVTN 313)。