I. Contexte académique et importance de la recherche Ces dernières années, la séparation de phase liquide-liquide des protéines (phase separation, PS), en tant que mécanisme clé de régulation des biomolécules intracellulaires, a suscité une vaste attention dans le domaine des sciences de la vie. La séparation de phase ne favorise pas seulement la f...

Contexte de la recherche et importance disciplinaire Dans les cellules eucaryotes, la structure spatiale tridimensionnelle de la chromatine joue un rôle essentiel dans la régulation de l’expression génique. Grâce à des repliements complexes, la formation de boucles et des réorganisations locales, l’ADN permet à différents éléments géniques (tels qu...

Ces dernières années, des technologies de pointe telles que le séquençage unicellulaire (single-cell RNA sequencing, scRNA-seq) et la transcriptomique spatiale (spatial transcriptomics, ST) ont profondément stimulé le développement des sciences de la vie et de la médecine clinique. Elles ont révélé l’hétérogénéité cellulaire et ont offert de nouvel...

Contexte académique et problématique de recherche Les micro-organismes, en tant que l’une des formes de vie les plus répandues sur Terre, entretiennent des relations étroites avec les océans, les sols ainsi que le corps humain. On estime que le corps humain héberge environ 350 000 milliards de cellules microbiennes (microbial cells), dont la présen...

I. Contexte et importance de la recherche Dans les domaines de l’oncologie et de la génomique, les altérations du nombre de copies chromosomiques (Copy Number Alterations, CNAs) représentent un type de variation génétique clé qui conduit à la survenue et à la progression du cancer. Les CNAs déterminent non seulement l’hétérogénéité tumorale, mais s...

Introduction générale : Révéler les goulets d’étranglement et les opportunités de la prédiction des interactions protéiques Les protéines, en tant que molécules centrales de l’activité vitale, participent à presque tous les processus biologiques et fonctions cellulaires, y compris l’expression des gènes, la transcription de l’ARN, la synthèse de l’...

Contexte académique et motivation de la recherche Avec la demande croissante de l’analyse d’échantillons complexes, la chromatographie, notamment la chromatographie en phase gazeuse bidimensionnelle couplée à la spectrométrie de masse (GC×GC–MS, Gas Chromatography coupled with Mass Spectrometry), s’impose comme une technologie de pointe dans des do...

Le cancer, en tant que défi majeur de santé publique mondiale, possède des mécanismes de survenue et de développement complexes. Depuis longtemps, des processus comme l’immunité, l’inflammation et l’angiogenèse du microenvironnement tumoral (tumor microenvironment, TME) ont attiré une large attention, étant considérés comme des déterminants importa...

Transcriptomique spatiale — Une technologie de pointe pour décrypter l’hétérogénéité spatiale des tissus La transcriptomique spatiale (Spatial Transcriptomics, ST) est une technologie de séquençage en plein essor ces dernières années, dont le cœur réside dans la capacité à combiner les informations d’expression génique et de localisation spatiale a...

Contexte académique L’analyse de la structure tridimensionnelle des complexes protéiques constitue un enjeu central en biologie structurale moderne, dans la recherche des mécanismes moléculaires, la conception de médicaments, voire la création de protéines artificielles. La fonction des protéines dépend le plus souvent de leur structure, et de nomb...