单细胞图谱揭示复发性胶质母细胞瘤中的免疫抑制微环境和Treg细胞景观

单细胞图谱揭示复发性胶质母细胞瘤中的免疫抑制微环境和Treg细胞分布 胶质母细胞瘤是最具侵袭性的脑肿瘤,具有极高的复发率和较差的预后。尽管许多研究已经对该疾病的肿瘤微环境进行了一些探讨,但对复发性胶质母细胞瘤的免疫微环境了解仍然非常有限。在这项研究中,研究团队使用单细胞RNA测序技术,揭示了复发性胶质母细胞瘤的免疫微环境,分析了脑脊液的潜在生物标志物,并比较了不同肿瘤位置的免疫特征。 研究背景 胶质母细胞瘤是极具恶性且易复发的脑癌,其特征包括血脑屏障(BBB)的特殊性、高异质性等。复发性胶质母细胞瘤患者的治疗选择有限,其内在分子改变致使其对常规治疗产生抵抗。了解这些肿瘤的分子和细胞组成有助于拓宽治疗选择。此外,免疫治疗作为一种理想的治疗方式,可以克服BBB针对肿瘤细胞。然而,肿瘤微环境中的一...

SDCBP在结直肠癌免疫治疗中的作用

Syndecan Binding Protein (SDCBP) 调节肿瘤微环境、肿瘤进展及抗PD1疗效在结直肠癌中的作用 背景介绍 近年来,免疫疗法为癌症治疗带来了革命性进展。然而,对于结直肠癌(Colorectal Cancer, CRC),抗程序性细胞死亡1(Anti-Programmed Cell Death 1, APD1)治疗在患者中表现出的疗效相对有限。仅有一个特定亚组的微卫星不稳定性(Microsatellite Instability, MSI)-高表达(MSI-H)的患者能从免疫检查点抑制剂(Immune Checkpoint Inhibitors, ICIs)治疗中获益,然而这类患者仅占总体CRC病例的15%,在晚期癌症病例中则更少,只有4-5%。因此,亟需探寻新靶点以...

Romidepsin 通过 DDIT4-mTORC1 通路展现抗食管鳞状细胞癌活性

Romidepsin 通过 DDIT4-mTORC1 通路展现抗食管鳞状细胞癌活性 食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)是全球最为常见的人类恶性肿瘤之一,具有高发病率和高死亡率。由于当前治疗选择有限,开发新型有效的治疗药物成为迫切需求。在本文中,研究者通过高通量药物筛选(high-throughput drug screening, HTS)技术对ESCC细胞系进行筛选,发现了组蛋白去乙酰化酶抑制剂罗米德辛(Romidepsin)在抑制ESCC细胞增殖、诱导细胞凋亡和细胞周期阻滞方面具有显著效果。实验结果还在ESCC细胞系衍生的移植瘤(CDX)及患者来源的移植瘤(PDX)小鼠模型中得到了验证。该研究由来自重庆医科大学及中南大学的研...

通过乳腺癌细胞系的染色质可及性分析识别特定谱系的表观遗传调控因子FOXA1和GRHL2

通过乳腺癌细胞系的染色质可及性分析识别特定谱系的表观遗传调控因子FOXA1和GRHL2 背景介绍 乳腺癌是一种异质性很强的疾病,目前临床上依赖于基因表达模式、内在分子亚型和激素受体/人类表皮生长因子受体2(HER2)的表达进行分类。然而,已有研究表明乳腺肿瘤在基因表达之外还存在明显的异质性。例如,一些雌激素受体阳性(ER+)乳腺癌的ER响应元件可及性降低,可能导致预后不良。基于这些发现,识别表观遗传状态对于更全面地理解乳腺癌异质性显得尤为关键。 乳腺癌细胞系是研究乳腺癌的重要模型,通常根据内在亚型和/或受体状态进行分类。然而,这些细胞系所隐藏的转录组表观遗传异质性尚未完全探明。因此,为了更准确地模拟乳腺癌并阐明其关键调控机制,解析乳腺癌细胞系的表观遗传景观尤为重要。 研究来源 这项研究由Li...

AAV介导的曲妥珠单抗中枢神经系统递送用于EGFR2阳性脑转移瘤

AAV介导的曲妥珠单抗中枢神经系统递送用于EGFR2阳性脑转移瘤 背景介绍 在乳腺癌治疗中,人表皮生长因子受体2(HER2)+ 的肿瘤表现出更为侵略性的特征,这给临床治疗带来了显著挑战。自1998年曲妥珠单抗(Trastuzumab,商品名赫赛汀®)获得批准以来,该药已显著改善HER2+ 乳腺癌患者的整体生存率。然而,对于发展为中枢神经系统(CNS) 的HER2+脑转移病例,由于存在脑血屏障及其他因素的影响,曲妥珠单抗在脑脊液中的半衰期较短(2-4天),传统的系统性抗HER2抗体治疗效果有限。因此,有必要寻求新的治疗途径来靶向HER2+ CNS疾病。 研究来源 本文的研究由Marcela S. Werner、Shweta Aras、Ashleigh R. Morgan等来自宾夕法尼亚大学佩雷...

一种用于术中识别人类脑肿瘤的可穿戴荧光成像设备

恶性胶质瘤(Malignant Glioma, MG)是最常见的原发性恶性脑肿瘤类型。手术切除MG依然是治疗的基石,且切除范围与患者生存期高度相关。然而,在手术中很难区分肿瘤组织与正常组织,这极大地限制了手术切除的效果。荧光成像是一项新兴技术,可以在术中实时可视化MG及其边界。然而,现有的临床级荧光成像神经外科显微镜由于成本高、便携性差、操作灵活性有限以及缺乏熟练的专业技术人员,导致应用率较低。为了克服这些限制,研究人员创新性地将微型光源、可翻转滤光片和记录摄像机集成到手术放大镜中,生成了一种可穿戴的荧光眼镜设备,用于术中的荧光成像。 来源 本文由Mehrana Mohtasebi、Chong Huang、Mingjun Zhao、Siavash Mazdeyasna、Xuhui Liu、S...

使用多波长激发的荧光光谱法稳健估计荧光团的显式基线模型

研究背景 荧光光谱是一种广泛应用于识别和量化荧光物质(荧光团)的方法。然而,当材料中包含其他荧光团(基线荧光团)时,量化感兴趣的荧光团变得具有挑战性,特别是当基线的发射光谱未明确定义且与目标荧光团的发射光谱重叠时。为了准确区分并量化这些荧光物质,研究人员提出了基于多波长激发荧光光谱的新方法。这项研究的主要目标是解决基线荧光干扰这一问题,并提供一种无需先验假设的稳健估计算法。 论文来源 这篇名为《An Explicit Estimated Baseline Model for Robust Estimation of Fluorophores Using Multiple-Wavelength Excitation Fluorescence Spectroscopy》的论文,作者包括A. Ga...

多视角时空图卷积网络与域泛化在睡眠阶段分类中的应用

睡眠阶段分类在睡眠质量评估和疾病诊断中至关重要。然而,现有的分类方法在处理时间延变的多通道脑信号的空间和时间特征、应对个体生物信号差异以及模型的可解释性方面仍然面临诸多挑战。传统的机器学习方法依赖于复杂的特征工程,而深度学习方法尽管在特征表示学习上表现出色,但在空间-时间特征利用、跨个体泛化能力以及模型可解释性方面仍有待提升。 为了应对上述挑战,北京交通大学的Ziyu Jia等人以及麻省理工学院的Li-Wei H. Lehman提出了一种多视角时空图卷积网络(Multi-View Spatial-Temporal Graph Convolutional Networks, MSTGCN),并结合域泛化用于睡眠阶段分类。 论文来源 这篇论文由北京交通大学计算机与信息技术学院的Ziyu Jia,...

具有注意力机制的时间依赖学习卷积神经网络在运动想象脑电解码中的应用

MI-EEG解码中基于注意力机制的时间依赖学习卷积神经网络(CNN) 研究背景与问题描述 脑机接口(Brain-Computer Interface, BCI)系统提供了一种通过实时翻译大脑信号与计算机进行通信的新途径。近年来,BCI技术逐渐在为瘫痪患者提供辅助和预防性护理方面发挥了重要作用。现有的许多BCI系统依赖于非侵入性且相对便捷的脑电图(EEG)信号记录来追踪大脑活动。然而,即使在同一MI任务期间,不同时期产生不同MI相关模式的时间依赖性特性也往往被忽略,从而大大限制了MI-EEG解码性能。 论文来源与作者信息 论文《A Temporal Dependency Learning CNN with Attention Mechanism for MI-EEG Decoding》于202...

物理信息驱动深度学习用于肌肉骨骼建模:基于表面肌电图预测肌肉力量和关节运动

肌骨模型已经广泛用于生物力学分析,因为它们能够估计难以通过活体直接测量的运动变量(如肌肉力量和关节力矩)。传统的物理驱动计算肌骨模型可以解释神经驱动到肌肉、肌肉动力学、以及身体和关节运动学和动力学之间的动态交互。然而,这些模型由于其复杂性,运行速度较慢,难以实现实时应用。近年来,数据驱动方法以其实现速度快和操作简单的优点成为一种有前途的替代方案,但它们不能反映基础的神经机械过程。 本文提出了一种融合物理知识的深度学习框架,用以实现肌骨建模。在该框架中,将物理领域的知识引入数据驱动模型,作为软约束对其进行罚则/正则化处理。本文采用表面肌电图(SEMG)同步预测肌肉力量和关节运动学作为示例,使用卷积神经网络(CNN)实现该框架,并在两个数据集上进行了实验验证,展示了该框架的有效性和鲁棒性。 论文...