学术背景 蛋白质稳态（proteostasis）是细胞维持正常功能的核心机制，其中泛素-蛋白酶体系统（Ubiquitin-Proteasome System, UPS）负责降解约80%的异常蛋白质。传统认知中，蛋白质需通过泛素化标记才能被26S蛋白酶体识别降解。然而近年研究发现，某些转录因子（如EGR1、FOSB）可不依赖泛素化直接被降解，这一现象与淋巴细胞的发育和恶性肿瘤密切相关。其中，Midnolin蛋白被证实是介导这一过程的关键因子，但其结构基础与分子机制长期未知。 本研究由UT Southwestern Medical Center的Bruce Beutler团队（2011年诺贝尔生理学或医学奖得主）主导，旨在通过冷冻电镜（cryo-EM）解析Midnolin-蛋白酶体复合物的三维结...

一、研究背景 帕金森病相关蛋白PARK7/DJ-1（以下简称PARK7）是一种多功能蛋白，在神经退行性疾病、癌症和炎症等多种病理条件下发挥重要作用。尽管缺乏传统的N端信号肽序列，PARK7能在应激条件下被分泌到细胞外，其分泌水平在多种疾病患者的脑脊液和血液中显著升高。然而，PARK7非常规分泌的具体机制长期未明。 先前研究表明，6-羟基多巴胺（6-OHDA）诱导的氧化应激可通过自噬途径促进PARK7分泌，但这一过程中PARK7如何被选择性转运至溶酶体腔，以及分泌性自噬溶酶体如何与质膜融合等关键问题尚未解决。本研究旨在揭示： 1. PARK7在氧化应激条件下通过分子伴侣介导的自噬（CMA, chaperone-mediated autophagy）途径转运至溶酶体的分子机制 2. 介导PARK...

一、研究背景 动脉粥样硬化（atherosclerosis）是心血管疾病的主要病理基础，其发生与血管内皮细胞（endothelial cells, ECs）功能紊乱密切相关。血流动力学因素在动脉粥样硬化的区域选择性中起关键作用：振荡剪切应力（oscillatory shear stress, OS）（如血管分叉处）促进斑块形成，而脉动剪切应力（pulsatile shear stress, PS）（如直血管段）具有保护作用。近年研究发现，ECs在OS作用下会出现代谢重编程（metabolic reprogramming），表现为糖酵解（glycolysis）增强，但具体分子机制尚未阐明。 表观转录组学（epitranscriptomics）领域发现，RNA的m6A甲基化修饰（N6-methy...

近年来，单细胞测序（single-cell RNA sequencing，scRNA-seq）与空间转录组学（spatial transcriptomics, ST）等前沿技术极大推动了生命科学与临床医学的发展。其揭示了细胞异质性，提供了疾病、发育、免疫等重大领域的全新洞见。然而，大规模单细胞数据由于技术噪声强、批次效应（batch effects）复杂、生物信号多样且杂乱，使得“准确提取与增强与表型相关的特征”成为关键挑战之一。许多传统方法虽主攻降噪、整合，却可能同时削弱乃至丢失关键的表型决策信号，限制了研究者对疾病机制与细胞间互作的深入理解。 一、研究背景与意义 单细胞表型相关特征的识别对于阐明疾病进展、免疫应答、肿瘤耐药等问题至关重要。例如，在癌症免疫治疗、个体化诊疗中，能否准确识别那...

癌症作为全球重大公共卫生难题，具有复杂的发生发展机制。长期以来，肿瘤微环境（tumor microenvironment，TME）的免疫、炎症、血管生成等过程被广泛关注，被视为肿瘤生物学行为的重要决定因素。近年来，癌症神经科学（cancer neuroscience）成为新兴交叉领域，发现神经系统不仅通过神经介质、递质等调控肿瘤发展，还通过神经－肿瘤细胞的直接或间接互作影响肿瘤的生长、转移与侵袭。尽管诸如“外周神经侵犯（perineural invasion, PNI）”等神经相关现象已受到关注，但系统性量化和评价“神经浸润”在肿瘤疾病中的广泛性、分子特征和临床意义仍处于初级阶段。本文报道正是基于这样的问题意识和科学背景展开，旨在深入探讨神经因素是否可作为肿瘤新标志性特征（cancer ha...

学术背景与研究意义 近几十年来，治疗性蛋白（therapeutic proteins）由于其在医学领域的巨大潜力，成为生物制药行业的研究重点。治疗性蛋白药物以其高度的靶向性为优势，被认为对许多以往难以治疗的急性或慢性疾病（如某些自身免疫病、癌症等）提供了解决方案。从1880年代血清治疗的发现到1986年首个单克隆抗体药物muromonab-CD3的推出，治疗性蛋白市场持续扩大，预计将在2032年达到近474亿美元。然而，治疗性蛋白引发免疫反应（immunogenicity）这一问题却一直困扰着药物研发人员。免疫反应既可能带来有害副作用，也可能激活治疗机制，例如疫苗就是通过激发体内免疫应答以实现免疫保护。 在蛋白药物所引发免疫反应的分子机制中，MHC（major histocompatibil...