基于APNet的稀疏深度学习模型在COVID-19严重程度驱动因素发现中的应用

学术背景 COVID-19大流行对全球公共卫生系统造成了巨大冲击,尽管目前疫情已有所缓解,但其复杂的免疫病理机制、长期后遗症(如“长新冠”)以及未来可能出现的类似威胁,仍然推动着相关研究的深入。特别是重症COVID-19患者,常伴随“细胞因子风暴”、急性呼吸窘迫综合征(ARDS)、多器官衰竭等严重症状,亟需更精准的预测模型和生物标志物来指导临床决策。 传统的机器学习(ML)和深度学习(DL)模型在高通量组学数据分析中表现出色,但往往缺乏生物可解释性,难以揭示非线性蛋白质动态(如翻译后修饰)和复杂的信号通路调控机制。为了解决这一问题,作者开发了APNet(Activity PASNet),一种结合了差异活性分析和生物信息驱动的稀疏深度学习模型,旨在通过可解释的预测发现COVID-19重症的驱动...

联合应用奋乃静和替莫唑胺抑制患者来源的胶质母细胞瘤肿瘤球

学术背景 胶质母细胞瘤(Glioblastoma, GBM)是一种高度恶性的原发性脑肿瘤,尽管目前已有标准治疗方案,如手术切除、放疗和化疗,但其预后仍然极差,患者的中位生存期仅为14.6个月。传统的治疗方法往往无法彻底根除肿瘤,且容易复发。因此,寻找新的治疗策略成为当务之急。近年来,药物再利用(Drug Repurposing)成为一种有前景的研究方向,即利用已批准用于其他疾病的药物来治疗胶质母细胞瘤,以缩短研发时间和降低成本。 多巴胺受体(Dopamine Receptor, DR)在胶质母细胞瘤中的表达和作用逐渐受到关注。研究表明,多巴胺受体D2(DRD2)和D3(DRD3)在胶质母细胞瘤细胞中高表达,并且DRD2的激活能够增强肿瘤的干性和侵袭能力。因此,多巴胺受体拮抗剂被认为是一种潜在...

谷氨酸脱氢酶1催化谷氨酰胺分解反馈激活EGFR/PI3K/AKT通路并重编程胶质母细胞瘤代谢

学术背景 胶质母细胞瘤(Glioblastoma, GBM)是最具侵袭性和异质性的中枢神经系统肿瘤之一,预后极差。尽管近年来抗血管生成治疗和免疫治疗等新型疗法不断涌现,GBM患者的生存期仍然非常有限。GBM细胞具有独特的代谢特征,尤其是在葡萄糖和谷氨酰胺的利用方面。葡萄糖代谢在GBM中已被广泛研究,而谷氨酰胺代谢的作用则相对较少被关注。谷氨酰胺不仅是癌细胞生长的重要营养物质,还参与核酸和脂肪酸的合成。然而,谷氨酰胺代谢在GBM信号传导和代谢重编程中的作用仍不明确。 本研究旨在探索谷氨酰胺代谢在GBM中的新机制,特别是通过谷氨酸脱氢酶1(Glutamate Dehydrogenase 1, GDH1)催化的谷氨酰胺分解代谢如何反馈激活表皮生长因子受体(Epidermal Growth Fact...

针对胶质母细胞瘤起始细胞的EVA1-抗体药物偶联物新型治疗策略

背景介绍 胶质母细胞瘤(Glioblastoma, GBM)是最具侵袭性的脑癌之一,患者的中位生存期仅为约15个月。尽管目前采用了手术、化疗和放疗等多种治疗手段,GBM患者的总体生存率在过去几十年中并未显著改善。近年来,研究发现GBM起始细胞(GBM-initiating cells, GICs)在肿瘤的发生、发展以及对放疗和化疗的抵抗中起着关键作用。这些细胞不仅具有强大的致瘤能力,还能抵抗常规的癌症治疗手段。因此,深入研究GICs的特性并开发针对这些细胞的新型治疗方法成为了GBM研究的重要方向。 在此背景下,研究团队先前发现了一种名为上皮V样抗原1(Epithelial V-like antigen 1, EVA1)的膜蛋白,该蛋白在GICs中特异性表达,并可能成为治疗GBM的新靶点。为了...

ROR1通过稳定GRB2促进胶质母细胞瘤生长并增强胶质瘤干细胞中c-fos的表达

学术背景 胶质母细胞瘤(Glioblastoma, GBM)是最常见且最具侵袭性的原发性脑肿瘤,其治疗难度大,预后极差。尽管近年来手术、放化疗等手段有所进步,但GBM患者的5年生存率仍低于4%。GBM的复发和治疗抵抗性主要归因于胶质瘤干细胞(Glioma Stem Cells, GSCs)的存在。GSCs具有自我更新、持续增殖和多向分化能力,被认为是GBM复发和治疗抵抗的关键因素。因此,针对GSCs的治疗策略成为GBM研究的重要方向。 ROR1(Receptor Tyrosine Kinase-Like Orphan Receptor 1)是一种受体酪氨酸激酶样孤儿受体,其在多种肿瘤中高表达,但在正常组织中表达水平极低。研究表明,ROR1在肿瘤干细胞(Cancer Stem Cells, C...

胶质瘤-星形细胞Connexin43通过激活E2F1/ERCC1轴赋予替莫唑胺耐药性

胶质瘤中Connexin43通过激活E2F1/ERCC1轴介导替莫唑胺耐药性的研究 学术背景 胶质瘤(glioma)是中枢神经系统中最常见且致命的肿瘤类型,替莫唑胺(temozolomide, TMZ)是其常规治疗药物。然而,TMZ治疗常常导致肿瘤复发和耐药性,严重限制了其疗效。肿瘤相关星形胶质细胞(tumor-associated astrocytes, TAAs)是肿瘤微环境的重要组成部分,越来越多的证据表明,Connexin43(Cx43)的异常表达与胶质瘤的进展和TMZ耐药性密切相关。然而,Cx43在胶质瘤和星形胶质细胞相互作用中如何介导TMZ耐药的具体机制尚未完全阐明。因此,本研究旨在探索Cx43在胶质瘤与星形胶质细胞相互作用中如何通过调控DNA修复机制导致TMZ耐药性。 论文来源...