汉族人全基因组测序:从端粒到端粒

T2T-YAO:汉族全长双倍体参考基因组的组装实现 科学背景 人类基因组计划(Human Genome Project, HGP)自发起三十年以来,生物医学研究领域设定了一个长期目标,即构建完整而精确的人类参考基因组。然而,受限于测序技术的局限性,长期以来难以达到这个目标所需的全面性和精确度。近年来,随着测序技术的突破,T2T(Telomere-to-Telomere,端粒到端粒)项目公布了第一个全长单倍体人类基因组,即T2T-CHM13v1.1。这一成果填补了8%先前未知的高重复区域,使基因组质量达到了Q73.94,即每24.8兆碱基一次错误。 然而,即使这一成就令人振奋,T2T-CHM13基因组并不是真实人类个体的代表,而是源于一个缺失Y染色体的完全葡萄胎(CHM)细胞系的单倍体基因组。...

TM7SF3 控制 TEAD1 剪接从而预防 MASH 诱导的肝纤维化

背景介绍 在现代社会中,代谢功能失调相关脂肪肝病(MASLD,previously NAFLD)是一种常见且严重的慢性肝脏疾病。然而,现有对其病理机制的了解还不完全,包括其进展至代谢功能失调相关脂肪性肝炎(MASH)、肝纤维化及其实质病态生理过程。肝纤维化是MASH患者死亡及肝脏不良事件的主要预测因素,而其发生主要由于肝星状细胞(HSC)的激活。抑制HSC的激活对阻止和减少MASH的纤维化至关重要。 Hippo信号通路和TEAD1(transcriptional enhanced associate DNA-binding domain transcription factor 1)是现存研究发现与多种疾病如炎症、纤维化和癌症密切相关的因子。然而,TEAD1如何在肝星状细胞中扮演角色尚未有深...

QDPR缺乏驱动胰腺癌中的免疫抑制

背景介绍 胰腺导管腺癌(Pancreatic Ductal Adenocarcinoma,PDAC)是一种具有高度免疫抑制性肿瘤微环境(Tumor Microenvironment,TME)的恶性肿瘤,对免疫检查点抑制(Immune Checkpoint Blockade,ICB)治疗具有较强的抵抗力,例如抗PD-1和抗CTLA-4治疗。肿瘤来源的髓源性抑制细胞(Myeloid-Derived Suppressor Cells,MDSCs)在肿瘤免疫抑制中起着关键作用,并导致包括PDAC在内的癌症的ICB抵抗。揭示这种免疫抑制机制将为增加ICB治疗效果提供新的策略。生物喋呤(Biopterin)代谢影响肿瘤的免疫环境,而生物喋呤代谢途径中关键酶二氢蝶呤还原酶(QDPR)的缺乏可能会造成ICB...

短期冷暴露在棕色脂肪中诱导了持久的表观基因组记忆

短期冷暴露在褐色脂肪组织中诱导了持久的表观基因组记忆 背景介绍 褐色脂肪组织(Brown Adipose Tissue, BAT)是哺乳动物中主要的非颤抖产热器官,在寒冷刺激下可以将化学能量以热的形式散发。褐色脂肪组织具有高密度的线粒体,这些线粒体中含有解偶联蛋白1(Uncoupling Protein 1, UCP1),该蛋白在电子传递链产生的质子梯度下通过释放脂肪酸来产生热量。BAT的激活,通过冷暴露、局部高热或β-肾上腺素激动剂,可能对人类代谢有益,通过燃烧储存的卡路里,抵抗2型糖尿病、胰岛素抵抗、肥胖和心血管疾病。 然而,个体之间的BAT质量和活动水平变化很大,这受到光照时间、环境温度、年龄、性别、身体质量指数(BMI)、血浆葡萄糖水平和糖尿病状态等因素的影响,这些个体差异很可能部分...

微生物代谢物通过抑制HIF-2α-鞘氨醇通路介导限时进食对MASH的有益效果

一种微生物代谢产物通过抑制 HIF-2A-神经酰胺通路中介时间限制进食对 MASH 的有益作用 引言 背景介绍: 代谢功能障碍相关脂肪变性肝病/代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(Metabolic Dysfunction-Associated Steatotic Liver Disease/Metabolic Dysfunction-Associated Steatohepatitis,MASLD/MASH)是一种影响全球四分之一人口的主要健康问题。MASLD 包括从肝脏脂肪变性到更具攻击性的 MASH,后者以坏死性炎症和纤维化为标志,可能发展成肝硬化和肝细胞癌。当前临床治疗主要集中于阻止 MASLD 的进展和逆转现有的 MASH。然而,由于其复杂的病理学和缺乏有效的医学干预手段,饮食和生活方式的...