DDX5通过可变剪接和G四联体展开抑制骨关节炎中的透明软骨纤维化和降解

DDX5抑制骨关节炎中透明软骨纤维化和降解的新机制 研究背景 骨关节炎(Osteoarthritis,OA)是一种以关节软骨退化、变性及骨质增生为主要特征的慢性退行性疾病。透明软骨纤维化常被认为是OA的终末病变阶段,导致细胞外基质(Extracellular Matrix,ECM)的变化。然而,透明软骨纤维化的机制目前尚不完全清楚。近期的单细胞测序研究显示,纤维软骨样软骨细胞在OA的病程中起到重要作用。已有研究表明,RNA解旋酶DEAD-box RNA helicase 5(DDX5)的缺失会导致软骨退化并加剧纤维样表型。然而,具体的调控机制仍需要进一步研究。 研究来源及发表信息 本文题为《Ddx5 inhibits hyaline cartilage fibrosis and degrad...

BRAF突变型转移性结直肠癌患者接受Encorafenib-Cetuximab治疗的生存分析

对癌基因突变性转移性结直肠癌患者采用恩可拉费尼-西妥昔单抗治疗的实效性-有效性分析的世代研究 研究背景 随着个体化医疗的发展,靶向治疗成为多种癌症治疗的重要手段。在转移性结直肠癌(mCRC)中,恩可拉费尼-西妥昔单抗的组合治疗被认为对预处理BRAF^V600E^突变患者有效。然而,即使是在随机控制的临床试验(如BEACON试验)中证明有效的治疗,也可能因实际应用条件的差异而导致有效性-实效性(efficacy-effectiveness)差距。由于回顾性世代研究可提供对总体患者的更全面认识,此项研究旨在评估临床实践中该药物组合治疗的真实世界有效性。 研究来源 作者: Koen Zwart, Sietske C. M. W. van Nassau, Frederieke H. Van der ...

利用透明机器学习与解释性AI提升胶质瘤预后

胶质瘤预后的透明化机器学习和解释性洞察力应用于解释性人工智能的赋能 学术背景 本研究致力于开发一种可靠的技术,来通过多种机器学习方法及深度学习方法,结合解释性人工智能(XAI,Explainable Artificial Intelligence)技术检测患者是否患有特定类型的脑肿瘤——胶质瘤。胶质瘤(glioma)是起源于胶质细胞的中枢神经系统癌症的一种,具有快速生长和侵袭健康脑组织的特性,常见的治疗方法包括手术、放射治疗、化疗等。通过整合患者数据,包括医疗记录、遗传档案等,机器学习算法能够预测每个个体对不同医疗干预的反应。 论文来源 该论文由Anisha Palkar、Cifha Crecil Dias(IEEE高级会员)、Krishnaraj Chadaga和Niranjana Sam...

CHD2调控儿童神经胶质瘤细胞与神经元的相互作用

CHD2调控儿科胶质瘤中神经元-胶质瘤相互作用的研究报告 背景介绍 高等级胶质瘤(High-grade gliomas,HGG)是成人和儿科患者中致命的疾病。近年来研究表明,神经元活动能促进多种高等级胶质瘤亚群的进展。然而,调控这一过程的表观遗传机制尚不明确。本文报告了一种新的表观遗传调控机制,即染色质重塑因子Chromodomain Helicase DNA-binding Protein 2(CHD2)在以肿瘤相关H3.1K27M突变为特征的弥散性中线胶质瘤(Diffuse Midline Glioma,DMG)中调控神经元-胶质瘤相互作用的角色。 研究来源 这项研究由Xu Zhang、Shoufu Duan、Panagiota E. Apostolou等多位作者联合完成,来自Colum...

D3S-001:一种具有快速靶标结合动力学的KRAS G12C抑制剂,抑制核苷酸循环,展现出强大的临床前和临床活性

D3S-001,一种具有快速靶点结合动力学的KRAS G12C抑制剂,抑制核苷酸循环并展示了强大的临床前和临床活动 背景介绍 KRAS(Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog)基因突变是多种实体瘤的明显变异类型(如非小细胞肺癌(NSCLC)和结直肠癌(CRC)等)的癌变驱动因素之一。KRAS突变主要是单碱基错义突变,常见位置包括第12位密码子的甘氨酸(G)到半胱氨酸(C)的突变,即KRAS G12C,这是在NSCLC中约14%的腺癌中,以及0.5%至4%的鳞状细胞癌中的主要突变形式。 过去几十年,针对KRAS的靶向治疗发现和开发一直是个具有挑战性的任务。KRAS是一种GTP酶,通过将鸟苷三磷酸(GTP)水解为鸟苷二磷酸(GDP)并在GTP绑定的活...

通过计算饱和诱变法鉴定克隆性造血驱动突变

引言 在健康的造血过程中,一组造血干细胞(Hematopoietic Stem Cells,简称HSC)贡献了所有与血液相关的谱系。然而,随着年龄的增长,这一过程常常会导致克隆性造血(Clonal Hematopoiesis,简称CH)的发生,即由某个HSC源头的克隆扩展,占据了很大一部分的血细胞和血小板。这个克隆扩展现象由HSC在生命过程中获得的躯体突变驱动,并在老年人群中高度普遍。与CH相关的基因突变赋予HSC生长优势,使其在造血过程中受到正选择(1-13)。近年来,大量研究表明,CH与血液恶性肿瘤发展、心血管疾病、全因死亡率以及实体肿瘤和传染病的风险增加相关(2, 7, 14-20)。尽管最近的深入研究已确认了大约60个CH驱动基因(1, 12, 13, 21),但我们对这些基因中的哪...

新型WRN解旋酶抑制剂选择性靶向微卫星不稳定癌细胞

在当今肿瘤治疗领域,精准医疗持续成为研究热点和发展趋势。随着科学技术的进步,人们开始更为精准地理解肿瘤细胞的特性及其生存的依赖性,以期找到新的治疗靶点。尤其是基于合成致死原理的策略,即针对肿瘤特有的遗传缺陷进行靶向治疗的药物研发,成为解决癌症治疗棘手问题的新希望。合成致死策略主要是基于肿瘤细胞与正常细胞在分子层面的差异,通过靶向那些对于肿瘤细胞存活至关重要,但对正常细胞影响较小的分子机制,达到选择性杀死肿瘤细胞,而不损害正常细胞的目的。 微卫星不稳定性(Microsatellite Instability, MSI)是一种肿瘤遗传特征,常见于一些错配修复(Mismatch Repair, MMR)缺陷型癌症,如结直肠癌、子宫内膜癌和胃癌等。由于这类肿瘤细胞在基因组DNA水平上存在不稳定性,它...

ror2在胰腺肿瘤和腺癌中的细胞可塑性调控

ror2在胰腺肿瘤和腺癌中的细胞可塑性调控

研究报告:ROR2在胰腺癌细胞可塑性中的调节作用 背景介绍 胰腺导管腺癌(PDAC)是一种致命的疾病,绝大部分患者缺乏治愈的可能性。这部分是因为难以早期检测。PDAC的特征之一是其广泛的肿瘤细胞异质性,这种异质性既体现在“经典型”和“基底样”分子亚型之间的变化,也反映了由于细胞间的可塑性导致的治疗抵抗深层机制。在PDAC的进展中,细胞可塑性贯穿始终,包括正常细胞转化为前癌变性病变和恶性肿瘤的过程,同时伴随着不同细胞身份的获取。 已有研究表明,不同的胰管和腺泡细胞在胰腺癌小鼠模型中可以生成PDAC。腺泡细胞在小鼠中更易于转化。炎症或KRASG12D的致癌表达会诱导腺泡细胞转化为具有导管样性质的前体细胞,即腺泡导管化生(ADM)。化生性导管细胞的特征是上调定义正常导管细胞的基因表达(例如KRT1...

肺腺癌的N6-甲基腺苷表观转录组学景观

肺腺癌的N6-甲基腺苷表观转录组学景观

肺腺癌中的N6-甲基腺苷修饰表观转录组图景 背景介绍 肺癌是全球最常见的癌症之一,同时也是导致癌症相关死亡的主要原因。非小细胞肺癌(non–small cell lung cancer,NSCLC)约占所有肺癌病例的80%-85%,其中肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)特别值得关注,因为它的生存率较低。因此,迫切需要更好地理解LUAD的分子机制和治疗策略。尽管在基因组学、转录组学、表观基因组学和蛋白质组学方面技术有了一定的进步,揭示了一些导致LUAD高致死性的遗传和基因组变异,但在肿瘤生物学中贡献较大的后转录机制仍未被深入挖掘。表观转录组学(epitranscriptomics),通常称为RNA的“表观遗传学”,包括了一系列修饰,其中N6-甲基腺苷(N6-methyl...

ZNF397缺陷触发TET2驱动的谱系可塑性和前列腺癌中的AR靶向治疗耐药性

ZNF397缺陷触发TET2驱动的谱系可塑性和前列腺癌中的AR靶向治疗耐药性

ZNF397缺乏引发TET2驱动的谱系可塑性和前列腺癌中的AR靶向治疗耐药性 学术背景及研究动机 现有的研究证据表明,癌细胞的谱系可塑性和表观遗传重新编程允许它们通过采用谱系可塑性来逃避谱系依赖的靶向治疗。然而,这些癌细胞利用表观遗传调控机制获得谱系可塑性和治疗抵抗性背后的机制仍然知之甚少。本文的作者们识别出锌指蛋白397(ZNF397)是一种真正的雄激素受体(AR)共激活子,在维持AR驱动的前列腺癌细胞中的内腔谱系中具有关键作用。ZNF397的缺失促进了癌细胞从AR驱动的内腔谱系向由TET2驱动的谱系可塑状态的转变,最终导致对AR信号抑制疗法的抗药性。令人着迷的是,该研究发现TET2抑制剂可以消除那些ZNF397缺乏肿瘤对AR靶向治疗的耐药性。这些发现揭示了前列腺癌通过表观遗传重塑获得谱系...