欧洲参考网络中罕见神经疾病的NGS质量保证

质量保证在未来高级测序诊断中的应用 背景介绍 过去十年中,下一代测序(Next-Generation Sequencing,NGS)在诊断稀有神经病(Rare Neurological Diseases,RND)领域取得了革命性进展。然而,技术、解释和报告标准的缺乏给确保全球一致和高质量的诊断带来了挑战。为了应对这一问题,欧洲稀有神经疾病参考网络(European Reference Network for Rare Neurological Diseases,ERN-RND)与欧洲分子遗传学质量网络(European Molecular Genetics Quality Network,EMQN)合作,建立了一个基于NGS的外部质量评估方案用于RNDs的诊断。 在21世纪,NGS方法逐渐成...

基于下一代测序的乳腺癌聚合风险评分位点基因分型局限性

基于下一代测序的乳腺癌聚合风险评分位点基因分型局限性 背景介绍 在遗传性乳腺癌(Breast Cancer, BC)的预测中,多基因风险评分(Polygenic Risk Scores, PRSs)正在日益广泛地应用,作为个体风险预测的一个重要工具。PRS的计算依赖于精确再现变异等位基因频率(Allele Frequencies, AFs),从而准确地预测PRSS的值。然而,目前使用下一代测序技术(Next-Generation Sequencing, NGS)进行多基因风险评分基因型分析时,存在不少技术上的限制。本研究的背景在于这些技术挑战,对改进和优化乳腺癌风险评估模型具有重要意义。 研究来源及作者背景 本研究由来自德国遗传性乳腺癌和卵巢癌联盟(German Consortium for...

预防性药物基因组学检测对现实环境中抗血小板治疗的临床影响

药物基因组学检测对抗血小板治疗的临床影响 背景介绍 药物基因组学(PGx)正在改变P2Y12抑制剂(抗血小板药物)的使用,这类药物广泛应用于急性冠状动脉综合征(ACS)、神经血管问题及血管疾病的治疗。其中,氯吡格雷(clopidogrel)是一种常用的P2Y12抑制剂,这种前体药物依赖多种途径转化为活性代谢物,主要通过细胞色素P450 2C19(CYP2C19)酶来完成。然而,携带CYP2C19基因中功能缺失等位基因(LOF)的人群,其氯吡格雷药效较低,这使得某些患者面临更高的主要不良心血管事件(MACE)风险。 CYP2C19基因分型可以识别LOF等位基因的患者,并建议他们从氯吡格雷转到不依赖CYP2C19途径的替卡格雷(ticagrelor)或普拉格雷(prasugrel)。现有研究多集...

通过突变分析发现人类聚合酶δ校对缺陷的隐性效应

通过突变分析发现人类聚合酶δ校对缺陷的隐性效应

人类Polymerase δ校对缺陷隐性效应的发现:通过对POLD1突变正常细胞及癌细胞的突变分析 背景介绍 DNA修复的破坏是导致遗传性癌症的主要机制之一。POLD1和POLE的外显子区域中的杂合致病变异会影响清除酶的校对活性,导致癌症易感综合症,表现为胃肠多发性息肉、结直肠癌、子宫内膜癌等增加风险。目前普遍的解释是,这些清除酶活性的丧失与癌症的发展是通过增加体细胞突变率产生联系。然而,关于这一假设的具体验证仍存在争议,研究者通过分析一个携带POLD1突变家族成员派生的成纤维细胞克隆和亲子间的新生突变来探索这一问题。 论文来源 本研究由Maria A. Andrianova、Vladimir B. Seplyarskiy、Mariona Terradas等人完成,他们来自于Institut...

临床基因组测序中偶然发现的评估与报告框架

临床基因检测中偶然发现的评估与报告框架 研究背景 在当前临床实践中,全基因组测序(clinical genome sequencing, CGS)逐渐成为诊断罕见遗传性疾病的重要手段。然而,基因组测序中常常会遇到意外发现(incidental findings, IFs),即与检测目的无关的意外结果。由于缺乏普遍接受的指南来指导IFs的返回,IFs的报告政策参差不齐,缺乏透明度。因此,研究者们开发了一套新的框架,用于指导在CGS过程中遇到的IFs的评估和返回。该框架重点关注IFs的临床意义和可操作性,并提出了分步方法和中止点,以推荐是否返回IFs。 论文来源 本文由Carolyn M. Brown、Laura M. Amendola、Anjana Chandrasekhar等多位研究者共同完...