台湾单中心 BFAST 数据库的非小细胞肺癌患者血液循环肿瘤 DNA 检测综合基因组分析

肺癌基因组学的最新研究:非小细胞肺癌的血液循环肿瘤DNA检测分析 背景和研究动机 近年来,非小细胞肺癌(NSCLC)的治疗因靶向治疗的成功而发生了显著变化。国家综合癌症网络指南建议对肺癌进行广泛的分子检测,以识别可能从靶向治疗中受益的患者。然而,NSCLC患者获取足够的组织活检样本变得越来越困难。由于生物标志物数量的增加,导致样本不足以进行全面的分子分析。此外,肿瘤位置和患者临床状况也使得组织收集非常具有挑战性。因此,通过血液中的循环肿瘤DNA(ctDNA)进行的下一代测序(NGS)有望克服这些组织检测的局限性。 研究来源 这项研究由Hsin-Yi Wang、Chao-Chi Ho、Yen-Ting Lin等多位医学博士和博士后研究员联合进行。他们分别来自National Taiwan Un...

全癌种调研揭示MYH变异的双等位基因失活和缺陷的碱基切除修复

跨癌种研究揭示 MUTYH 基因双等位基因失活及不同类型实体瘤的碱基切除修复缺陷 研究背景 在日常生活中,细胞常常暴露于内源性和外源性的氧化应激,这些应激来自于细胞呼吸的副产物以及接触各种外源性化合物。MUTYH 是碱基切除修复(Base Excision Repair, BER)通路中的关键组成部分,负责修复内源性和外源性来源的氧化DNA损伤。氧化损伤最常见的产物之一是8-氧-7,8-羟基鸟嘌呤(8-oxoG)。MUTYH 通过切除错误配对的腺嘌呤,防止这些氧化损伤引起的G:C到T:A转变突变,从而在多种高暴露于氧化损伤和频繁细胞分裂的组织中发挥重要作用。 BER 通路的缺陷与突变负担增加和致癌性相关联。MUTYH 基因的双等位基因致病变异(biallelic germline patho...

都市安全净化医院的遗传性癌症筛查与结果

遗传性癌症综合征的筛查与结果:都市安全网医院的研究 研究背景 遗传性癌症综合征(Hereditary Cancer Syndromes, HCS)患者患癌的终生风险较高。然而历史上服务不足的群体进行基因评估的率较低。鉴于此,研究者试图了解在城市安全网患者人群中进行HCS评估的人口学因素。 文章信息 本研究由Sydney Brehany, MD; Meryl Colton, MD; Cassandra Duarte, MD; Michael Baliton, BS; Alec S. McCranie, BA; Sonia Okuyama, MD联合完成。来源于美国临床肿瘤学会(American Society of Clinical Oncology)发行的期刊《JCO Precision O...

罕见未分化肉瘤样胰腺癌亚型的基因组分析

罕见的胰腺癌未分化肉瘤亚型的基因组特征 学术背景 胰腺导管腺癌(Pancreatic Ductal Adenocarcinoma,简称PDAC)是最致命的癌症之一,具有早期侵袭和转移的特性。未分化肉瘤癌(Undifferentiated Sarcomatoid Carcinoma,简称USC)是PDAC的一种特别凶险但罕见的亚型,占所有PDAC病例的2%-3%。USC的组织学特征包括缺乏腺体分化和存在间质样梭形细胞。由于其稀少性,USC的基因组景观和肿瘤微环境(Tumor Microenvironment, TME)未被充分表征,现有信息主要来自个案报告和小样本队列研究。 先前的一些个案报告提示免疫检查点抑制剂可能在USC治疗中有效。相比之下,免疫治疗在PDAC治疗中效果不佳。然而,以往在六...

乳腺癌脑转移分析揭示人类EGFR2阳性疾病中CDK12结构重排的富集

脑转移性乳腺癌中的CDK12结构重排富集现象研究报告 研究背景与目的 乳腺癌(Breast Cancer,BC)是涉及中枢神经系统(Central Nervous System,CNS)的第二常见实体肿瘤。脑转移性乳腺癌(Breast Cancer Brain Metastases,BCBMs)在患有转移性乳腺癌的患者中越来越常见。活跃的脑转移患者通常被排除在临床试验之外,使得这一领域在临床研究方面处于劣势。下一代测序(Next-Generation Sequencing,NGS)技术的应用使得人们能够对脑转移癌进行表征,并与原发性肿瘤进行比较,从而揭示其基因组差异。此外,以前的研究已经表明BCBMs中存在与免疫检查点和聚(ADP-核糖)聚合酶(PARP)抑制剂相关的基因改变和基因组特征,提...

人类CEACAM1在免疫细胞上的高维度表达图谱及其与黑色素瘤药物耐药性关联

高维映射人类CEACAM1在免疫细胞上的表达与黑色素瘤耐药性的关联 研究背景 人类癌胚抗原细胞粘附分子1(CEACAM1)是一种通过同源及异源配体结合发挥作用的抑制性细胞表面蛋白。在人体肿瘤中的免疫细胞上该蛋白的表达尚不清晰。尽管PD1和PD-L1作为免疫疗法的靶点取得了重大进展,但依然存在一部分患者的肿瘤对这些疗法产生了耐药性。为了理解造成耐药性的相关因素并识别潜在的新疗法靶点,本研究意图详细绘制黑色素瘤患者CEACAM1、PD1和PD-L1在不同免疫细胞亚群中的表达情况,进而探究其与治疗耐药病状态的关系。 研究来源 本项研究由Yu-Hwa Huang等多位学者共同完成,研究结果发表于2023年的《Communications Medicine》期刊上。作者分别来自多个著名研究机构,包括哈...

衰老引起的Hapln1丧失通过间接上调黑色素瘤内皮ICAM1破坏血管完整性

年龄相关的HAPLN1丧失通过间接上调黑色素瘤内皮细胞ICAM1破坏血管完整性 在2024年3月发表于《Nature Aging》上的一篇题为《Age-dependent loss of HAPLN1 erodes vascular integrity via indirect upregulation of endothelial ICAM1 in melanoma》的研究文章揭示了一项重要的研究成果。这项研究由Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health生化与分子生物学系的Gloria E. Marino-Bravante和Ashani T. Weeraratna领导的团队完成,旨在探讨年龄相关的黑色素瘤微环境中HAPLN1(Hyalur...

通过PD-L1信号诱导的上皮−间质转化预测PD-L1高表达肺癌对免疫检查点抑制剂的响应欠佳

肿瘤细胞内在PD-L1信号诱导上皮间质转化(EMT)在PD-L1高表达的肺癌中预测免疫检查点抑制剂响应不良 研究背景及动机 在癌症免疫治疗中,程序性死亡配体-1(Programmed Death Ligand-1,简称PD-L1)通过与免疫细胞上的程序性死亡受体-1(Programmed Death-1,PD-1)结合来抑制免疫反应。然而,基于阻断PD-1/PD-L1相互作用的免疫检查点抑制剂(Immune Checkpoint Inhibitors,ICIs)已成为治疗非小细胞肺癌(Non-Small-Cell Lung Cancer,NSCLC)的主要方法之一。尽管PD-L1阳性患者对PD-1/PD-L1阻断的响应率约为40%,但仍需找到更有效的生物标志物来预测ICI治疗的效果。 大量研...

通过同时阻断肿瘤微环境中的CCR1和CXCR2实现协同抗肿瘤活性

通过同时阻断肿瘤微环境中的CCR1和CXCR2实现协同抗肿瘤活性

通过双重阻断CCR1和CXCR2在髓系细胞中的表达实现协同抗肿瘤活性 背景介绍 结直肠癌(Colorectal Cancer, CRC)是全球健康危机,近年来其发病率和死亡率迅速上升。在过去15年中,CRC的死亡率增加了30%以上,未来十年预计还将增加25%。尽管手术、放疗、化疗以及分子靶向药物方面取得了显著进展,但远端转移,特别是肝转移,仍是导致结直肠癌预后不良的重要原因,至少有三分之一的患者存在此类情况。 肿瘤微环境(Tumor Microenvironment, TME)在肿瘤进展和转移中发挥关键作用。TME包括癌细胞、免疫细胞、间质细胞以及各种宿主细胞(如巨噬细胞、成纤维细胞和间质干细胞)。这些成分通过诸如TGF-β、TNF和NF-κB等信号通路进行丰富的串扰,驱动肿瘤生长、侵袭、血...

缺氧和辐射后再氧合作用诱导的HMHA1/ARHGAP45表达促进癌细胞HIF依赖性侵袭

癌细胞在缺氧和放射后再氧化诱导的HMHA1/ARHGAP45表达对癌细胞侵袭的贡献:依赖于HIF的机制 背景与研究动机 在本文研究之前,已有大量研究表明,固体肿瘤中的癌细胞在缺氧(hypoxia)环境下会获得例如侵袭性和抗治疗性等恶性特征,导致患者预后差(参考文献[3]、[6])。缺氧诱导因子(Hypoxia-Inducible Factor, HIF)作为代谢酶调节的主要角色,参与了许多缺氧响应的关键因子的调控。 特别是在放射治疗后,癌细胞在严重缺氧区域内幸存下来,经历了放射再氧化处理后,其侵袭性通过HIF依赖机制增强,进一步迁移到肿瘤血管附近从而导致复发。然而,这些再氧化处理后,HIF如何具体介导癌细胞的侵袭性变化,还尚未完全明确。为了解决这一科学问题,本研究主要针对HIF依赖机制如何在...